海关查货的指令来自于两个方面，一个是电脑随机检查。海关对一切出口货品都有检查的份额，由后台电脑系统随机检查，另一个是人工布控查验。向海关单一窗口申报的每个报关单，后台都是有官员在仔细审阅的，他们发现可疑之处，就命令查货，要求现场的官员针对疑点进行核对。
1) 从单一窗口打印出海关查验告诉书，告诉报关公司的报关员，组织操作人员把现已入库的货品移到海关指定的查验区域。
2) 预备全套查验文件（发票、箱单、运单、报关单和查验告诉书以及报关员的个人信息）
4) 提早抵达查验指定区域等候海关关员前来查验，必定要等海关关员的答应方能开箱验货，不得提早开箱。
5) 查验结束后，再回到查验中心办公室等候海关关员做查验记载，成果便是放行或不放行。如有问题，海关关员会奉告详细是什么样的问题，把查验用的一整套的文件转到海关的处置科，由处置科再做后续处理。
6) 若需求改单，需求出示整套文件，包含海关处理意见，删单改单请求表、客户的状况阐明等文件一同上传到单一窗口修撤单界面，请求改单即可。
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