收获与保管是种子管理中的重要环节，必然的联系到种子的质量，建议水稻种子收获做好以下几个方面：
一是选择最佳收割时间。一般水稻95%以上颖壳发黄，谷粒定型变硬，米粒呈透明状，即可收割，一般比稻米提前收割3-5天。如若天气情况不允许，收割时间也可适当延迟几天。
二是防止机械混杂。水稻收割前拔除杂株。单品种收割，机械收割换品种前收割10米后倒仓清粮，单存不可留做种子。单品种晾晒，单品种贮藏，提高种子纯度。
三是水分含量符合规定标准。机械收割后马上摊开薄晒，每天轻轻翻动数次，同时在晾晒过程中要扫除大枝梗、碎叶和稻曲病粒等。要充分干燥，使种子含水量降到14.5%以下，以利安全贮藏。
四是加强仓储管理。进仓前做好水分检验，进仓后做好稻种贮藏期间要常常检验核查，及时通风、透气，调节温、湿度，以免种子发热引起霉烂变质。
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